菌痢在世界范围内广泛流行，大流行时给人们带来严重的危害，我国多呈散在发病，有时可有小流行。因而采取有效预防措施可以防止发病。预防措施要抓今天一个环节，即管理好传染源，切断传播途径和保护易感人群，在日常生活中做到饮食卫生，提倡熟食，具体措施如下：
1.隔离病人：确诊菌痢的患儿进行隔离治疗，对带菌者也应及时诊治，患儿用过的餐具进行煮沸消毒，一般煮15分钟以上；粪便可在容器内加入粪便量1/5漂白粉或倍量的10％, 搅拌均匀后放置1-2小时才可倒入粪池中。大便后要清洁臀部，勤换尿布，尿布要烫洗，被褥和衣服要在阳光下暴晒，这样可控制感染。隔离到症状消失，每日大便<2次，外观正常，停药后经大便二次培养阴性为止。
2.养成良好的卫生习惯：培养小儿从小注意个人卫生，养成饭前，便后洗手的习惯，勤剪指甲，不让孩子用牙咬指甲或吸吮手指。教育孩子不应随地大小便，不在地上玩耍。
3.注意饮食卫生：不吃不干净的食物。婴幼儿牛奶或其他乳制品一定要煮沸后消毒后再喂小孩，剩奶在冬天可以在喂奶前再次煮沸，而夏天不要吃剩奶。食用的白糖一般不干净，加入奶中也要煮沸后再喂孩子。奶瓶和奶头用后洗干净，每天煮沸消毒1次，年长儿不吃生菜，不喝生水和腐败变质不干净的生冷食品，生吃的瓜果要洗干净，最好用开水烫了再吃。食物要新鲜、菜板、菜刀要生熟分开，把好“病从口入”。
4.提倡母奶喂养：婴儿出生后4-6个月内应单纯母乳喂养，尤其在婴儿患病或病后更应坚持母乳喂养，因为母乳对增强婴儿体质有一定好处。要掌握正确的喂养方法。给孩子增加奶量或添加辅食时要逐渐增加，不宜加得太多。
5.大力消灭苍蝇和其孳生地生地，切断传播途径。
6.保护易感人群，对接触过菌痢的小孩，应观察七天。但目前尚无行之有效的措施，人体免疫性的防御菌痢的方法。因而预防细菌性痢疾应包括上述各项措施。
